К промежуточному мозгу относятся таламус и гипоталамус. В состав моторных ядер таламуса входит вентролатеральных ядро. Именно Юди направляются импульсы от мозжечка, базальных ганглиев, а от этих ядер - моторной зоны коры большого мозга.
Гипоталамическая участок имеет многочисленные афферентные и эфферентные связи с различными отделами ЦНС и играет главную роль в поддержании гомеостаза, влияя на функции вегетативной нервной и эндокринной систем. Гипоталамус участвует в регуляции обмена веществ, функций органов пищеварения и кровообращения, поддержание температуры тела на постоянном уровне, а также в формировании многих поведенческих реакций, связанных с голодом, насыщением, жаждой, сном, половыми реакциями подобное. Важная роль гипоталамуса в приспособлении (адаптации) организма к различным условиям существования, в частности к физическому труду.