Аксон, кроме проведения ПД, может транспортировать различные физиологически активные вещества, преимущественно пептиды. Они синтезируются в соме нейрона, а оттуда волокном - до синаптических структур. Различают быстрый аксонного транспорт (около 40 см за 1 сутки) и медленный (около 20 см за 1 сутки). В процессе транспорта по аксону вещества превращаются в более простые пептиды.
Некоторые вещества могут транспортироваться в обратном направлении - ретроградно. К ним относится ацетилхолинэстеразы. Возможно, этот транспорт имеет большое значение для синтеза белка в соме нейрона, поскольку после перерезания аксону этот транспорт нарушается.
