Тимус образуется в значительной мере за счет вентральных отделов третьего канала и в меньшей степени - четвертого канала. Зачатки тимуса сближаются, срастаются и перемещаются в каудальном направлении. В эпителиальные зачатки вилочковой железы проникают мезенхимальные клетки, а затем и лимфоциты, предшественники которых образуются в красном костном мозге. Эпителий тимуса превращается в ретикулоэпителиальную ткань, которая внешне напоминает ретикулярную соединительную ткань. К концу третьего месяца ретикулоэпителий тимуса заселяется лимфоцитами.
Паращитовидные железы образуются из дорсальных частей третьей и четвертой жаберных карманов. Они имеют вид эпителиальных соединений, которые отделяются от места своего возникновения и проникают в поверхностные участки щитовидной железы. У млекопитающих за счет выстеленной глоточной кишки образуется рудиментарная пятая пара жаберных карманов, которые, отшнуровываясь, превращаются в так называемые постбранхиальные тельца. Их клеточные элементы проникают в щитовидную железу, образуя клетки, продуцирующие полипептидный гормон - тиреокальцитонин, который является антагонистом гормона околощитовидных желез - паратирина.
